一般情况下，胆结石引起的疼痛可能是生理因素导致的，也可能是病理因素导致的，如胆囊收缩、胆道扩张等。具体分析如下：
一、生理因素
1、饮食习惯
凌晨三四点通常是人体处于饥饿状态的时间段，有些人可能会在夜间饮食，尤其是摄入高脂肪、高胆固醇的食物，这可能会刺激胆囊收缩并引发胆绞痛。
2、迷走神经兴奋
夜间机体的迷走神经兴奋，交感神经的作用减弱，导致胆囊收缩，胆汁排出，可引起疼痛。
二、病理因素
1、胆囊收缩
胆囊在夜间可能会收缩，特别是在凌晨三四点这个时间段，这是因为人体的生物钟对胆囊的收缩和胆道的运动有调控作用。胆囊的收缩可能导致胆结石被推向胆囊的出口或者胆道，从而引起疼痛。
2、胆道扩张
胆道在夜间可能会扩张，这可能会导致胆结石卡在胆道中，引起疼痛。
除了上述原因外，凌晨时候胆结石疼痛还可能跟胆绞痛有关。胆结石患者如果经常出现疼痛，建议及时进行治疗。
