咽拭子和抗原检测区别在于采样标本不同、采样部位不同、灵敏度不同等。
1、采样标本不同：咽拭子通常需要采集，患者的咽喉后壁处黏膜分泌物。抗原检测通常需要采集患者鼻腔黏膜的分泌物进行检测。
2、采样部位不同：咽拭子采集标本的部位一般是咽喉，需要将棉签深入患者的咽喉部位采集。抗原检测采集标本的部位通常是鼻腔内部，需要将棉签深入鼻腔内部进行采集。
3、灵敏度不同：咽拭子检测的时间虽然比慢，但是相较于抗原检测结果通常会比较准确。抗原检测结果的优点在于容易操作，并且检测的时间较短出具结果快，但是可能没有咽拭子检测的准确性高。
另外，咽拭子和抗原检测的区别也包括检测方式不同，例如抗原检测可以自行操作，咽拭子需要送往实验室进行检查。
