一般来说，替硝唑和甲硝唑区别在于临床应用不同、副作用不同、药效持续时间不同。具体情况分析如下：
1、临床应用不同
替硝唑对各种常见的致病厌氧菌，以及滴虫的杀灭作用比甲硝唑强了2~4倍，而且甲硝唑是第一代硝基咪唑类抗菌药，替硝唑是第二代。
2、副作用不同
甲硝唑的副作用一般是恶心，呕吐，上腹痛，而替硝唑的副作用比甲硝唑少，仅仅有轻微的头晕，眩晕，便秘，或者是皮肤瘙痒、皮疹等症状。
3、药效持续时间不同
替硝唑的药效持续时间比甲硝唑更长，甲硝唑口服后有效浓度只能维持12小时左右，替硝唑口服后有效浓度能维持18小时左右。
总之，两种药物都是抗厌氧菌活性的药物，需要注意的是这两种药物均经肝脏代谢，肝功能不全的患者应在医生指导下酌情调整剂量。
