新生儿一只眼睛有眼屎的治疗方法要根据引起的原因，比如不注意卫生、泪道阻塞、结膜炎、角膜炎、过敏等。
1、不注意卫生
如果日常不注意清洁卫生，没有及时清除眼屎，眼屎中的细菌和分泌物可能在眼睛周围积聚。通常可不用特殊治疗，注意在接触新生儿眼睛之前清洗双手。
2、泪道阻塞
泪道阻塞之后，泪液无法正常排出，从而导致眼屎积聚在眼角。如果症状比较轻，可不用特殊治疗，如果比较严重，可以到医院由医生进行阻塞切开、鼻泪管义管手术的方法治疗。
3、结膜炎
炎症会导致眼结膜血管扩张和渗出，进而刺激结膜细胞产生更多的分泌物，形成眼屎或眼脓。建议在医生的指导下使用醋酸泼尼松龙滴眼液、双氯芬酸钠滴眼液、复方硫酸软骨素滴眼液等药物消除炎症。
4、角膜炎
角膜炎引发眼角膜的炎症，可能会导致角膜周围的眼结膜受到刺激和炎症，产生分泌物，形成眼屎。可使用珍珠明目滴眼液、色甘酸钠滴眼液、盐酸左氧氟沙星滴眼液等药物，缓解症状，但是新生儿用药通常有较多禁忌，需要严格按照医生要求用药。
5、过敏
如果新生儿接触到过敏原，可能会导致眼部发生过敏反应，导致眼屎增多、瘙痒等症状发生，比如花粉、化妆品、动物皮屑等。可遵医嘱使用抗过敏药物治疗，比如盐酸西替利嗪口服溶液、复方苯海拉明麻黄碱糖浆、地氯雷他定干混悬剂等。
日常注意新生儿用药前，建议到医院就诊，进行相关检查，明确具体病因，在医生的指导下，选择合适的方法治疗，不可盲目用药，避免引起不适。
