CT检查使用的是X射线，X射线对人体的敏感器官会有一定的伤害，尤其是胎儿和儿童。所以不建议怀孕3个月以内的孕妇做任何腹部的X线类检查，除非有非常大的医学必要，目前孕妇完全可以选择其它非X线类的检查，比如超声、磁共振。
其次就是儿童，因为儿童很多的器官结构发育不够成熟、不够完善，对射线较为敏感，在接受射线照射后可能会产生细胞染色体的畸形改变，甚至极少情况下会诱发一些恶性肿瘤，所以儿童CT检查须慎重，如果有其它能替代的检查方法就要避免CT检查，但是有时必须依靠CT来诊断，做CT也不是不可以的。
CT设备均有减少射线剂量的儿童检查模式可选。给家长朋友们要提醒的一句话就是如果带着孩子去做CT检查，可以向相关工作人员要求，尽可能利用铅衣或铅围脖对孩子的敏感器官如甲状腺、性腺的进行屏蔽保护。
