病理的应用特别广泛，像手术切除的标本都需要送到病理科，明确病变性质；再如胃镜、肠镜、支气管镜、膀胱镜等钳取的标本，也需做病理检查才能明确是良性、恶性病变；还有像穿刺组织、以及体液，如胸腹水、尿液、痰等都需要做病理以明确体液的性质。
手术中可能也需要做病理，主要为冰冻病理检查，以明确病变是良性、恶性，决定手术范围；癌症病人在化疗前和化疗后也需要做病理，评判化疗药的疗效，评估患者的预后；
早期癌症的发现也需要做病理，像宫颈癌做TCT、HPV等，能够及早发现宫颈的早期病变，便于医生更好的进行疾病评估，给病人的早期诊治争取时间。
