目前诊断流感的实验室方法主要有两种，一种是流感病毒的抗原检测，另一种是核酸检测。这两种方法，各有优劣。
抗原检测
方法简便，无需特殊仪器设备，各基层单位均可开展；出结果快，急诊检测一般一小时内可出报告；收费低，花费少。而其缺点，存在敏感性较核酸检测低，体内流感病毒含量较低时可能漏检；某些特殊类型流感病毒变异株无法检测出来，阴性不能排除感染；未纯化，易受鼻咽或口咽部的其他物质干扰等。
核酸检测
敏感性高，哪怕在体内流感病毒含量较低时，也可以检测出来；针对流感病毒的相对保守区位点进行扩增检测，受病毒变异影响小；核酸经过纯化，受干扰小。而其缺点，存在方法繁琐，需先对核酸进行提取，再进行扩增，需要特殊的设备及严格的实验室环境要求；出结果慢，不适用于急诊检测；收费较高，花费多。
对于临床医生或患者本人，该如何选择这两种检测方法呢？
1、对于流感症状明显、有明确的接触史、急需诊断及治疗的患者，可先选择抗原检测，抗原检测阳性，即可诊断甲型流感，应及早治疗。
2、对于抗原检测阴性，但临床仍然高度怀疑甲型流感感染的患者，建议选择核酸检测。
3、对于已感染者的治愈判断或疗效监测，大多数情况下，抗原检测阴性即可初步判断恢复；但后期如果有手术、生物制剂、免疫抑制等医疗需求，建议进行核酸检测，严格判断是否痊愈。
4、如果出现新的特殊变异株，且市面上抗原检测无法获得有效结果，可选择核酸检测。
当然，在每年的9月～11月接种流感疫苗，是最有效的预防流感的措施。同时，流感病毒每年都会发生新的变化，产生新的优势毒株，因此流感疫苗每年都会有更新，即建议每年都要接种。
