同房期间来月经，后期又停了可能是因为生理原因、宫颈炎、子宫内膜炎等原因导致，可通过一般治疗、使用药物、手术等方法改善。具体分析如下：
1、生理原因
女性在排卵期时，由于卵巢分泌的雌激素水平升高，可能会引起子宫内膜增生和膨胀，从而导致在同房期间出现少量出血。如没有伴随其他症状，属于正常现象，不需特殊治疗。
2、宫颈炎
宫颈炎是常见妇科疾病，由于性生活的刺激和宫颈炎的存在，可能会导致宫颈黏膜出现糜烂和溃疡，引起局部出血等症状。患者可在医生的指导下使用伊曲康唑胶囊、阿奇霉素分散片等药物治疗。
3、子宫内膜炎
子宫内膜炎是由细菌感染引起的子宫内膜炎症，炎性分泌物刺激可能会导致子宫内膜出现充血、糜烂和溃疡等症状。症状比较严重的患者可通过宫腔镜手术治疗。
除以上原因外，还有可能是因为子宫息肉、卵巢囊肿、输卵管粘连等原因导致。如果出现同房期间出血，应及时就医进行诊治，排除可能的疾病或情况，并进行针对性的治疗。平时还需要保持外阴部位清洁干燥，勤换内裤，饮食也要以清淡为主，以免症状加重。
