一般情况下，免疫系统的问题会影响怀孕。具体分析如下：
免疫系统是人体的一种防御系统，可以识别和消灭入侵人体的病原微生物、异物和肿瘤细胞。一个健康的免疫系统对于维持身体内的稳态和对抗病原体起着重要作用。免疫系统的异常可能导致自身免疫性疾病，如类风湿性关节炎、红斑狼疮、肝炎等等。这些疾病可能会影响生育能力，造成不孕不育或者生育风险增加。例如，自身免疫性疾病中的抗磷脂抗体综合症可以导致反复流产、早产、胎儿发育迟缓、妊娠期高血压综合症等并发症。免疫系统的问题也可能导致着床失败、胚胎发育异常等问题。此外，免疫系统的过度活跃也会导致排斥胎儿，造成习惯性流产。
因此，如果存在免疫系统问题，建议在怀孕前就进行全面的体检，及时采取措施控制免疫系统异常。同时，建议在怀孕期间定期接受产前检查，及时发现和治疗任何可能的问题，以保障母婴健康。
