新生儿囟门凹陷有可能是身体脱水导致的，也可能是缺钙、营养不良等原因导致的。
1、身体脱水
新生儿身体各器官发育尚不成熟，而且身体免疫功能也不太完善，容易受到各种因素影响，出现大便次数增多、腹泻或频繁呕吐等情况，通常会引起身体脱水或电解质紊乱，出现囟门凹陷，还可能伴有口唇干燥、尿量减少或泪少、皮肤弹性下降等现象。
2、缺钙
一般情况下，新生儿囟门是平坦的，由于新生儿出生后身体发育比较快，会消耗体内大量钙质，如果没有及时补钙容易引起缺钙，将新生儿竖着抱起，通常会发现存在囟门凹陷的现象。
3、营养不良
新生儿出生后如果喂养不当，或其免疫力比较弱，容易生病，通常会引起营养不良、身体消瘦等情况，长时间下去也可能会导致新生儿囟门凹陷。
