吃大豆异黄酮的副作用通常要根据患者所处的具体状态，比如是孕期、未成年或患有雌激素方面的疾病进行分析。
1、孕期
孕期的女性相对较为特殊，如果此时吃大豆异黄酮极易导致药物的有效成分通过母体被胎儿吸收，对其造成一定的负面影响，严重情况下甚至还可能会导致胎儿的发育出现异常。
2、未成年
未成年的女孩由于还处于发育阶段，自身的卵巢和子宫相对并不成熟，此时如果服用了大豆异黄酮，就可能会使自身的雌激素水平大幅度增加，对女孩的发育情况造成影响，甚至导致其出现早熟。
3、患有雌激素方面的疾病
本身就患有雌激素方面的疾病，比如子宫内膜炎或子宫内膜息肉的患者，在服用大豆异黄酮后，就可能会导致雌激素在体内堆积，严重甚至会产生癌变。
