三叉神经痛的根本原因在于颅内血管移位对神经的压迫导致脱髓鞘，从而导致神经传导形成异常环路而产生症状，所以从病因上治疗是最根本的、首选的治疗方式。显微血管减压术就是通过手术的方式将血管和神经分开，从病因上来根治疾病。
当然，并不是所有的患者一发病就需要手术，因为三叉神经痛在初发阶段，有一定的自然缓解期，同时对卡马西平等药物很敏感，可以选择口服药物治疗。但当疾病发展到一定时期，药物控制效果不佳，或者药物副作用太大，这时就需要考虑显微血管减压术来治疗了。
当然，患者如果一开始就拒绝吃药，同时对三叉神经痛的病因有科学的认识，可以直接选择手术，避免吃药带来的副作用。将压迫三叉神经的血管移位，解除神经压迫，从发病原因根本上来根治疾病，不留任何后遗症。如果患者因身体状况不佳或高龄难以耐受手术可以选择三叉神经半月节球囊压迫或射频治疗，也可以缓解除疼痛。但射频或球囊压迫是神经毁损手术，患者会伴有面部麻木不适等神经毁损后遗症，所以是不能耐受手术的患者的被迫选择。
