紫河车含多种抗体及干扰素，多种激素，酶类，红细胞生成素，磷脂，多糖类，亦含蛋白质，糖钙，维生素，免疫因子，女性激素，助孕酮，类固醇激素，促进性腺激素，促肾上腺皮质激素等。
紫河车中含有所谓"尿激酶抑制物"，能抑制尿激酶对纤维蛋白溶酶元的"活化"作用。
紫河车含有的γ-球蛋白中含有麻疹、流感等抗体和白喉抗毒素等，能够起到预防或减轻麻疹等传染病的作用。不过因为是蛋白质，空口服无效，需要注射。
紫河车在生理上能产生绒毛促性腺激素，对卵巢作用比较小，对睾丸有兴奋作用，而且能产生雌激素和孕激素，胎盘中可能含有这些激素，因此紫河车具有这些激素的药理作用。
